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Morfometría Geométrica

 

Curso de Postgrado:

"Introducción a la MORFOMETRÍA GEOMÉTRICA"

Postgrado, INECOL.

Xalapa, Ver

Marzo a Mayo, 2008.

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Informes: Alejandra Valencia,  Oficina del Posgrado

 

Profesor:

Dr. Efraín De Luna,

Depto. Biodiversidad y Sistemática, INECOL, Xalapa, Ver

Feb 12: Inscripción

Programa Tentativo

Requisitos. Preferentemente conocimientos previos de morfometría en general. Familiaridad con los conceptos y métodos de la estadística multivariada, particularmente Análisis de Componentes Principales y Análisis de Variables Canónicas. Desde luego, por favor repasen los conceptos básicos de promedio, varianza y correlación. Aquí es donde los apuntes del "kinder" sobre el Teorema de Pitágoras se vuelven importantes.

 

Plan general. Entraremos en cierto detalle en los métodos de registro, las técnicas de superposición, cálculo de distancias Procrustes, partial warps y relative warps para análisis de ordenación (PCA y CVA) y estadísticos (regresiones, Manovas, calculo de niveles de significancia mediante boostraps)

 

Horario. El curso esta programado con sesiones matutinas de 9 am a 1pm,  Lunes, Miércoles y Viernes. Diez semanas a partir del 3 de Marzo, 2008.

Clases

Las presentaciones de las clases estarán disponibles en PDFs. El acceso al directorio será restringido para los participantes del curso mediante una combinación de "usuario" y "palabra clave" que deberán solicitar a E. De Luna, después de comprobar su registro.

Libro de texto

El libro de texto que recomendamos es:

Zelditch ML, Swiderski, HD Sheets & WL Fink. 2004.  Geometric Morphometrics for Biologists: A primer. Elsevier Academic Press.

Lecturas Básicas

Antes de la semana del curso, por favor lean las siguientes referencias básicas:

Rohlf, F.J. 1990. Morphometrics. Annual Review of Ecology and Systematics 21: 299-316.

Slice D.E 2005. Modern Morphometrics (Chp 1). En:  Modern Morphometrics in Physical Anthropology. p1-45. (alguien tiene el PDF?).

Zelditch et al 2004.  Introduction (Chp. 1). En: Zelditch ML, Swiderski, HD Sheets & WL Fink. Geometric Morphometrics for Biologists: A primer. Elsevier Academic Press.

Referencias

Aquí encontraran referencias de artículos para las distintas partes del temario. Algunos artículos están disponibles aquí en PDF. Si alguien tiene otros PDFs bienvenidos, por favor envíenlos por correo electrónico para anexarlos a la lista.

Libros

Una lista de libros sobre estadística, morfometría y procesamiento de imágenes digitales.

Software para el curso (Windows XP)

Sesiones Prácticas. Generalmente por las tardes dedicaremos sesiones para aprender a usar programas para los métodos de registro (tpsDig), las técnicas de superposición (CoordGen), cálculo de distancias Procrustes, Partial Warps y Relative Warps para análisis de ordenación (PCA y CVAGen).

En preparación para la semana del curso, por favor tomen la iniciativa e instalen tpsDig, tpsUtil y el paquete IMP en la computadora que llevarán al curso. Instrucciones para instalar IMP (PDF).

Enlaces para descargar instaladores de programas para el curso

tpsDig

Para registrar coordenadas.

tpsUtil

Para administrar las tareas de registro

IMP Software

Para generar coordenadas comunes mediante técnicas de superposición (CoordGen) y para ordenar los componentes de la deformación relativa (PCAGen, CVAGen).

Instrucciones para instalar IMP

Manuales para la operación de los programas individuales de IMP (PDFs preparados por D. Sheets)

PAST

 Paleontological Statistical Analysis.

PAST User Manual. Excelente introducción a conceptos y las operaciones para hacer los análisis estadísticos. (en PDF).

 

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Editor: Efraín De Luna, Depto. de Biodiversidad y Sistemática, INECOL , AC.

Creado:  Julio, 2006. Modificado: 17 Mar 2009