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 Curso: "Introducción a la MORFOMETRÍA GEOMÉTRICA"


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Programa de Clases

 

 Tema  
 Semana 1  
0. Presentación del curso  
 Clase 1 Introducción (13 pp).  
 Clase 2 Hipótesis (19 pp). Conceptos de probabilidad, espacios, modelo Normal, escalas, medidas, precisión, exactitud, error.  
1. Imágenes  
 

Clase 3 Imágenes (32 pp). Tamaño, resolución, niveles, codificación de color. Recomendaciones. Despliegue. Pixeles a puntos de luz, monitores, resolución, tamaño. Ejemplos.

  
 Semana 2  
 Clase 4 Registro (11 pp).  Contornos, Distancias entre marcas. Software para registro y análisis. Matrices de configuración.  
 Clase 5 Registro (10 pp).  Coordenadas de marcas.  Software para registro (tpsDig) y análisis (IMP). Matrices de configuración.  
 Lab 1: Métodos de Registro. Software: tpsUtils, tpsDig  
 Semana 3  
2. Geometría y Estadística  
 Clase 5 Vectores (22 pp). Espacios, Geometría de vectores, Teorema de Pitágoras. Suma, combinación lineal. Producto, ortogonalidad, base ortonormal, rotación.  
 Clase 6 Espacios (26 pp). Distancias. Coordenadas. Geometría de configuración, espacios de ajuste, planos de proyección.  
 Lab 2: Métodos de Registro. Software: tpsUtils, tpsDig  
 Semana 4  
 Clase 7 Ejemplos (xx pp).  Aplicación de métodos de la morfometría geométrica en Biología.   
 Clase 8 Ajustes 1 (29 pp). Eigen-análisis del espacio de las distancias. Transformación, ortogonalización, normalización, centrado, rotación y proyección.  
 Lab 3: Métodos de Registro. Software: tpsUtils, tpsDig  
 Semana 5  
 Clase 9 Ajustes 2 (18 pp). Espacio de las coordenadas. Métodos de superposición. Análisis de Procrustes. Espacio de Kendall, manifolds y distancias Procrustes.  
 Clase 10 Proyecciones (18 pp). Espacios tangentes. Coordenadas Procrustes parciales, TPS y su descomposición.   
 Lab 4: Métodos de Superposición. Software: IMP CoordGen  
 Semana 6  
 Clase 11 TPS (19 pp). Placa delgada de deformación.  Componentes de la deformación. Eigen-análisis de la matriz de energía de deformación. Partial Warps. Visualización del cambio relativo de forma.  
 Lab 5: Métodos de Superposición. Software: IMP CoordGen  
 Lab 6: Métodos de Superposición. Software: IMP CoordGen  
 Semana 7  
 Clase 12 Variación (23 pp). Promedio, varianza, covarianza, varianza generalizada, varianza total. Modelos, estimacion y errores. Modelos lineales: regresion, eje principal, componentes principales, variables canónicas.  
 Clase 13 Métodos de Ordenación. Análisis de Componentes Principales (PCA).  Rotaciones rígidas.  
 Lab 7: Métodos de Ordenación. Software: IMP PCAGen  
 

Semana 8

  
 Clase 14. Métodos de Ordenación. Análisis de Variables Canónicas (CVA). Rotaciones no rígidas.  
 Lab 8: Métodos de Ordenación. Software: IMP CVAGen  
 Semana 9  
 Presentación de artículos  
 Lab 9: Métodos de Ordenación. Software: IMP CVAGen  
 Semana 10  
 Presentación de Proyectos  
 Lab 10: Combinando métodos morfométricos