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Programa de clases

Programa modificado: 07-Feb-2019

Este es el programa casi final para la version 2019 en el Posgrado del INECOL (Xalapa)

Noten que la hora de inicio el Lunes es a las 9 am para la inauguración formal. Después de Martes a Viernes la primera clase es a las 9:00 am.

En la sesion de la mañana habrá un descanso de 15 minutos alrededor de las 11 am, para café y bocadillos. Al medio dia tendremos 1 hora y 15 mins para la comida. La sesión de la tarde será de 2:15 a 5 pm.

Al inicio de cada día se presentan los conceptos y teoría básica. Al menos tres horas cada día se dedican a adquirir experiencia en el uso de software especializados para el registro de la forma, los análisis morfométricos y estadísticos.

  Tema Horario
  Lunes 11 marzo (día D)
 
 

Bienvenida e Inauguración

9:00 am
0. Presentación del curso 9:30 am
  Clase 1: Introducción (23 diapositivas). Morfometría Tradicional y Morfometría Geométrica. Protocolos de investigación. Estructura del curso. [Efraín] 9:45
1. Datos  
  Clase 2: Métodos de registro (14 d). Descriptores numéricos de la forma y el tamaño. Distancias entre puntos. Coordenadas de puntos. Marcas y semi-marcas. [Jorge] 10:15
 

receso (15 mins)

10:45
 

Clase 3: Métodos Registro de contornos (12 d). Contornos con semi-marcas. Plantillas. Matriz de configuraciones. [Jorge]

11:00
2. Geometría  
 

Clase 4: Conceptos y principios de Geometría, parte 1 (34 d). Espacios, Geometría de vectores. Suma, combinación lineal. [Efraín]

11:45
  Lab 1: Registro de puntos. Software: tpsUtils, tpsDig. [Marcia] 12:15
 

comida (90 mins)

1:00  pm
 

Lab 2: Métodos de registro de contornos con gradillas en MakeFan. Software: tpsUtils, MakeFan, tpsDig. [Marcia]

2:15

  Lab 3: Métodos de registro combinando marcas y semi-marcas con curvas en tpsDig. [Jorge]

3:30

  Comentarios finales 5:00
  Martes 12 marzo (día S)
 
  Clase 5: Conceptos y principios de Geometría, parte 2 (34 d). Espacios, Geometría de vectores. Productos. Rotaciones. [Efraín] 9:00 am
  Lab 4: Métodos de Registro mezclando marcas y semimarcas. Software: tpsUtils, tpsDig, MakeFan [Jorge] 10:30
 

receso (15 mins)

11:00
 

Clase 6: Espacios (27 d). Espacios no-Euclidianos. Matrices de Coordenadas. Geometría de configuración, hiperesferas, espacios de ajuste por superposición, hiperplanos de proyección. [Efraín]

11:15
3. Análisis morfométricos  
  Clase 7: Superposición (27 d). Espacio de las coordenadas. Métodos de superposición. Análisis de Procrustes. BC, SBR, GLS, RFTRA. [Marcia]
12:15
 

comida (75 mins)

1:00  pm

Clase 8: Comparación de formas (24 d). Espacio de Kendall. Coordenadas Procrustes. Forma consenso. Distancias Procrustes. Promedio y Varianza. [Efrain] 2:15
 

Lab 5: Métodos de Superposición. Software: IMP CoordGen. [Jorge]

4:00
  Comentarios finales 5:00
  Miércoles 13 marzo (día W)
 
  Clase 9: Proyecciones (25 d). Espacios tangentes. Manifolds. Coordenadas Procrustes parciales. Deformación relativa. [Efraín] 9:00 am
 

Clase 10: Proyectos individuales. Bloques de 12-15 mins para presentaciones individuales. Participantes: .... voluntarios???

10:00
 

receso (15 mins)

11:00
  Clase 11: Warps (35 d). Placa delgada de deformación (TPS).  Componentes de la deformación generalizada. Eigen-análisis de la matriz de energía de deformación. Principal Warps, Partial Warps, Relative Warps. Visualización del cambio relativo entre un par de formas. [Efraín] 11:15
 
!Fotografia oficial del grupo!
12:45 pm
 

comida (75 mins)

1:00  pm
  Lab 6 : Métodos de Superposición y alineamiento de contornos. Software: IMP CoordGen y SemiLand. [Marcia] 2:15
 

Clase 12: Proyectos individuales. Bloques de 12-15 mins para presentaciones individuales. Participantes: .... voluntarios???

3:30

  Comentarios finales 5:00
  Jueves 14 marzo (día E)
 
4. Análisis Estadísticos  
  Clase 13:  Variación (23 d). Promedio, varianza, covarianza, varianza generalizada, varianza total. Modelos, estimacion y errores. Modelos lineales: regresion, eje principal, componentes principales, variables canónicas. [Efraín] 9:00 am
 

Clase 14: Métodos de regresión. (xx d). Forma vs tamaño. Forma vs función. [Sandra]

10:00
 

receso (15 mins)

11:00
 

Lab 7: Métodos de regresión. Software: IMP Regress. [Sandra]

11:15
 

Clase 15: Métodos de Ordenación. (xx d). Análisis de Componentes Principales (PCA).  Rotaciones rígidas. [Marcia]

12:15
 

comida (75 mins)

1:00  pm
  Lab 8: Métodos de Ordenación. Software: IMP PCAGen [Marcia] 2:15
  Lab 9: Métodos de Disparidad. Software: IMP PCAGen [Jorge] 3:45
  Comentarios finales 5:00
  Viernes 15 marzo (dia R)
 
 

Clase 16: Métodos de Ordenación. (xx d). Análisis de Variables Canónicas (CVA).  Rotaciones no rígidas. Análisis Discriminantes.  Distancias de Mahalanobis. MANOVA. [Jorge]

9:00 am
  Lab 10: Métodos de Ordenación. Software: IMP CVAGen [Jorge]
10:00 am
 

receso (15 mins)

11:00

Lab 11: Análisis morfométricos con R (Geomorph) [Sandra] 11:15
 

comida (75 mins)

1:00  pm
  Clase 17: Aplicaciones. Métodos comparativos, filogenia, evolución morfológica. 2:15
  [Marcia, Sandra, Jorge y Efrain]  
  Comentarios finales. 4:30
  Clausura del curso. 4:45
     

Profesores



Dr. Efrain De Luna,
INECOL, Xalapa, Ver.
sitio web >

Dr. Jorge Chollet, Lab. de Morfometría, INECOL. Xalapa. sitio web

Dra. Marcia Ramírez-Sánchez. FES Zaragoza, UNAM, CDMX
sitio web >

Dra. Sandra Ospina, INECOL. sitio web