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Programa tentativo de clases

Programa modificado: 12-Jul-2017

Este es el programa en desarrollo para la version 2017 en el IIA, UNAM. Todavia se ajustará en los siguientes dias. Esperamos tener listo el contenido, horarios, etc para la segunda semana de Agosto.

Noten que la hora de inicio el Lunes es a las 9 am para la inauguración formal. Después de Martes a Viernes la primera clase es a las 9:30 am, en vista de los tiempos de transporte hacia CU. En la sesion de la mañana habrá un descanso de 15 minutos alrededor de las 11 am, para café y bocadillos. Al medio dia tendremos 90 minutos para la comida. La sesión de la tarde será de 3 a 5 pm.

Al inicio de cada día se presentan los conceptos y teoría básica. Al menos tres horas cada día se dedican a adquirir experiencia en el uso de software especializados para el registro de la forma, los análisis morfométricos y estadísticos.

  Tema Horario
  Lunes
 
 

Bienvenida e Inauguración.

9:00 am
0. Presentación del curso 9:30 am
  Clase 1: Introducción (23 diapositivas). Morfometría Tradicional y Morfometría Geométrica. Protocolos de investigación. Estructura del curso. [Efraín] 9:45
1. Datos  
  Clase 2: Métodos de registro (14 d). Descriptores numéricos de la forma y el tamaño. Distancias entre puntos. Coordenadas de puntos. Marcas y semi-marcas.[Marcia] 10:15
 

receso (15 mins)

10:45
 

Clase 3: Métodos Registro de contornos (12 d). Contornos con semi-marcas. Plantillas. Matriz de configuraciones. [Marcia]

11:00
2. Geometría  
 

Clase 4: Conceptos y principios de Geometría, parte 1 (34 d). Espacios, Geometría de vectores. Suma, combinación lineal. [Efraín]

11:45
  Lab 1: Registro de puntos. Software: tpsUtils, tpsDig. [Marcia] 12:15
 

comida (90 mins)

1:30  pm
 

Lab 2: Métodos de registro de contornos. Software: tpsUtils, MakeFan, tpsDig. [Marcia]

3:00

  Lab 3: Métodos de registro en 3D. Introducción al uso del MicroScribe. [María]

4:00

  Comentarios finales 5:00
  Martes
 
  Clase 5: Conceptos y principios de Geometría, parte 2 (34 d). Espacios, Geometría de vectores. Productos. Rotaciones. [Efraín] 9:30 am
  Lab 4: Métodos de Registro mezclando marcas y semimarcas. Software: tpsUtils, tpsDig, MakeFan [Marcia] 10:30
 

receso (15 mins)

11:15
 

Clase 6: Espacios (27 d). Espacios no-Euclidianos. Matrices de Coordenadas. Geometría de configuración, hiperesferas, espacios de ajuste por superposición, hiperplanos de proyección. [Efraín]

11:30
3. Análisis morfométricos  
  Clase 7: Superposición (27 d). Espacio de las coordenadas. Métodos de superposición. Análisis de Procrustes. BC, SBR, GLS, RFTRA. [Marcia]
12:30
 

comida (90 mins)

1:30  pm

Clase 8: Comparación de formas (24 d). Espacio de Kendall. Coordenadas Procrustes. Forma consenso. Distancias Procrustes. Promedio y Varianza. [Marcia] 3:00
 

Lab 5: Métodos de Superposición. Software: IMP CoordGen. [Marcia]

4:00
  Comentarios finales 5:00
  Miércoles
 
  Clase 9: Proyecciones (25 d). Espacios tangentes. Manifolds. Coordenadas Procrustes parciales. Deformación relativa. [Efraín] 9:30 am
  Lab 6 : Métodos de Superposición y alineamiento de contornos. Software: IMP CoordGen y SemiLand. [Marcia] 10:15
 

receso (15 mins)

11:15
  Clase 10: Warps (35 d). Placa delgada de deformación (TPS).  Componentes de la deformación generalizada. Eigen-análisis de la matriz de energía de deformación. Principal Warps, Partial Warps, Relative Warps. Visualización del cambio relativo entre un par de formas. [Efraín] 11:30
  !Fotografia oficial del grupo! 1:00 pm
 

comida (90 mins)

1:30  pm
 

Clase 11: Proyectos individuales. Bloques de 12-15 mins para presentaciones individuales. Participantes: ....???

3:00

  Comentarios finales 5:00
  Jueves
 
4. Análisis estadísticos  
  Clase 12:  Variación (23 d). Promedio, varianza, covarianza, varianza generalizada, varianza total. Modelos, estimacion y errores. Modelos lineales: regresion, eje principal, componentes principales, variables canónicas. [Efraín] 9:30 am
  Clase 13: Métodos de Ordenación. (xx d). Análisis de Componentes Principales (PCA).  Rotaciones rígidas. [Marcia] 10:30
 

receso (15 mins)

11:15
  Lab 7: Métodos de Ordenación. Software: IMP PCAGen [Marcia] 11:30
  Clase 14: Métodos de Ordenación. (xx d). Análisis de Variables Canónicas (CVA).  Rotaciones no rígidas. Análisis Discriminantes.  Distancias de Mahalanobis. MANOVA. [Marcia] 12:30
 

comida (90 mins)

1:30  pm
  Lab 8: Métodos de Ordenación. Software: IMP CVAGen. [Marcia? Efrain?] 3:00
  Lab 9: Modularidad y Asimetría. Software: MorphoJ. [Maria] 4:00
  Comentarios finales 5:00
  Viernes
 
  Clase 15: Métodos de regresión. (xx d). Forma vs tamaño. Forma vs función. [Sandra] 9:30 am
  Lab 10: Métodos de regresión. Software: IMP Regress.
10:30 am
 

receso (15 mins)

11:15

Lab 11: Análisis morfométricos con R (Geomorph) 11:30
 

comida (90 mins)

1:00  pm
  Clase 16: Aplicaciones. Métodos comparativos, filogenia, evolución morfológica. 3:00
  Comentarios finales. Entrega de constancias. 4:00
  Clausura del curso. 4:30
     

Profesores


Dr. Efrain De Luna,
INECOL, Xalapa, Ver.
sitio web >

Dra. Marcia Ramírez-Sánchez. UNAM, México DF
sitio web >

Dra. Sandra Ospina, CIBYC, UAEM. Cuernavaca. sitio web

M. en A. María García Velasco, IIA / FFL, UNAM. (ayudante)