Fecha

Tema

MARZO 

2

Fundamentos de Biología Molecular

     Niveles de organización genética

     Funcionamiento de los genes

     Organización y evolución del genoma

4

     Tasas evolutivas y reloj molecular

     Homología a nivel molecular

Distribución de artículos para clase

Lab.   6

Seguridad en el laboratorio. Manejo y almacenamiento de Substancias Químicas. Colecta de tejido y métodos de preservación.

Discusión de los intereses de los estudianes

Distribución de ensayos

9

Marcadores moleculares para medir la variación genética

     Origen de la variación genética

     Polimorfismo

     Tipos de marcadores moleculares

     Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)

     Diseño de oligonucleótidos

Optimización de la PCR

     Electroforesis en agarosa y acrilamida

11

Introducción a PopGene

Presentación de artículos

Lab.   13

Extracción y purificación de ADN genómico.

16

Marcadores Moleculares a partir de proteínas

     Isozimas. Introducción

     Definición y nomenclatura

     Detección e interpretación de bandas

Ventajas, desventajas y aplicaciones de las isoenzimas

18

Introducción a Arlequín

Presentación de artículos

Lab.   20

Amplificación y purificación de productos de PCR. Digestión de productos de PCR con enzimas de restricción.

23

Marcadores Moleculares a partir de ADN

     RFLPs - restriction fragment length polymorphism. Introducción

     Bases genéticas

     Selección de las enzimas de restricción

     Transferencia por "Southern"

     Generación de sondas específicas para RFLPs

     Detección e interpretación de bandas

     Ventajas, desventajas y aplicaciones.

RAPD - random amplified polymorphic DNA;

     DAF-DNA amplification fingerprinting

25

Elaboración de Matrices con MacClade y Mesquite

Presentación de artículos

Lab.   27

Electroforesis de RFLPs y captura de imágenes. Generación de la matriz de datos de RFLPs

30

     AP-PCR-Arbitrary primer-PCR. Introducción

     Fuentes del polimorfismo

     Artificios de la amplificación

     Detección e interpretación de bandas

     Aplicaciones

     AFLP - amplified fragment length polymorphism. Introducción

Bases genéticas

     Detección e interpretación de bandas

     Electroforesis de capilar

     Ventajas, desventajas y aplicaciones.

ABRIL

1

Introducción a Winclada, Nona y TNT

Presentación de artículos

Lab.   3

Secuenciación cíclica y purificación de las reacciones de secuencias

6-10

NO HAY LABORES

13

Single strand conformation polynmorphism (SSCP);

     Single nucleotide polymorphisms (SNPs);

     Denaturing gradient gel - electrophoresis (DGGE).

     Detección e interpretación de bandas.

     Aplicaciones

15

PRIMER EXAMEN PARCIAL

Lab.   17

Secuenciación cíclica y purificación de las reacciones de secuencias

20

     SSR - simple sequence repeats (microsatellites).

     Introducción

     Distribución en el genoma

     Tasa de mutación

SSR. Detección

     Genescan

     Ventajas, desventajas y aplicaciones

22

     Introducción a PAUP

Presentación de artículos

Lab.   24

Continúa… Secuenciación cíclica y purificación de las reacciones de secuencias

27

     STS - sequence tagged site;

     EST - expressed sequence tags.

     Sequence characterized amplified regions (SCARs).

     Introducción

     Aplicaciones

Secuenciación de ADN

     Estrategias y métodos

29

     UPGMA y Neighbor-joining con PAUP

Presentación de artículos

MAYO

Lab.   1

     Análisis de electroferogramas

     Edicion de secuencias

     Alineamiento y búsquedas en GenBank

     Búsquedas en BLAST

     Ingreso de secuencias a GenBank-Sequin

4

     Química de la secuenciación cíclica

     Interpretación de electroferogramas

     Ventajas, desventajas y aplicaciones

     Estrategias de alineamiento de secuencias. Manuales vs. Algoritmos

6

Introducción a Máxima verosimilitud con Modeltest y PAUP

Presentación de artículos

Lab.   8

Alineamiento y análisis de secuencias

11

Estructura secundaria

     Codificación de regiones problemáticas

     Traducción de secuencias a proteínas

13

SEGUNDO EXAMEN PARCIAL.

15

Presentación oral de ensayos